بای‌پس معده که اغلب به روش لاپاروسکوپی (جراحی بسته ) انجام می‌شود سردسته جراحی های چاقی و متابولیک است. موفقیت سایر روشها با آن سنجیده میشود و عمل استاندارد طلائی نامیده می‌شود. هدف از این عمل این است که اولاً بیمار چاق غذای کمتری میل کند.ثانیاً این مقدار غذا مسیر مشترک کمی با صفرا در تماس باشد. لذا جذب کمی داشته باشد. رسیدن سریعتر غذا به انتهای روده و همچنین میانبر زدن اثنی عشر باعث اثرات شگفت آور بای‌پس بعنوان جراحی متابولیک درمان دیابت است. این روش در بیماران با BMI بالای ۴۰ که رده چاقی درجه ۳ یا مفرط هستند، اساسی‌ترین روش درمانی محسوب می‌شود. این دسته از بیماران بارها رژیم‌های غذایی مختلف را تجربه کرده ولی متأسفانه قادر به کاهش وزن در حد وزن ایده‌آل خود نشده و پس از پایان دوره‌ی رژیم درمانی به وزنی به مراتب بیش‌تر از وزن اولیه‌ی خود بازگشته‌اند .

بیماران چاق مبتلا به دیابت نوع دوم، پرفشاری خون، ریفلاکس معده به مری و بیمارانی که دچار مشکلاتی بدنبال انواع دیگر جراحی چاقی شده اند از این روش بیشترین سود را می‌برند. عمل بایپس لاپاروسکوپی به دو روش کلاسیک R&Y و مینی بایپس انجام میگیرد. روش مینی بایپس سوء جذب بیشتری دارد و لذا نیاز به مصرف مکمل ویتامینی بیشتر از نوع کلاسیک پیدا می‌کنند.